Forklaret: Hvordan TrueNat-testen virker

SARS-CoV-2-virussen, der forårsager Covid-19, har ikke et DNA, men et RNA-molekyle. Revers transkriptionsprocessen (RT i RT-PCR) omdanner RNA'et til DNA-molekylet, før genet kan fanges i testen.

En testprøve indlæses på en TrueNat-chip. (Kilde: Molbio Diagnostics)

For et par uger siden godkendte Indian Council of Medical Research (ICMR) brugen af TrueNat maskiner , fremstillet af en Goa-baseret virksomhed, til at udføre bekræftende tests for Covid-19 sygdom. Før det blev disse maskiner, som oprindeligt blev udviklet til at påvise tuberkulose hos patienter for et par år siden, kun brugt i den nuværende coronavirus-pandemi til screening af patienter.

Efter ICMR-godkendelsen søges disse maskiner nu af en række stater, især dem, der mangler et stærkt laboratorienetværk, der er påkrævet for at udføre de traditionelle RT-PCR-tests. Mens Uttar Pradesh har fået 117 maskiner til at blive indsat i alle sine 75 distrikter, har Bihar bestilt 50 maskiner. Jharkhand, Chhattisgarh, Odisha, Telangana, Andhra Pradesh har alle søgt efter disse maskiner, og mange af disse er allerede blevet indsat.

Hvordan virker TrueNat?

For at forstå det hjælper det at forstå, hvordan de traditionelle PCR-tests fungerer. PCR er en metode til at fange et specifikt gen fra DNA'et i podningsprøven og multiplicere det gennem en række kemiske processer, så det kan påvises ved hjælp af fluorescerende farvestoffer. De fleste moderne PCR-tests, som også bruges til at detektere andre slags vira, fungerer i realtid. Resultatet er synligt, selv mens kædereaktionen finder sted.

SARS-CoV-2-virussen, der forårsager Covid-19, har ikke et DNA, men et RNA-molekyle. Revers transkriptionsprocessen (RT i RT-PCR) omdanner RNA'et til DNA-molekylet, før genet kan fanges i testen.

TrueNat er et chip-baseret, batteridrevet RT-PCR-kit. I starten kunne det kun identificere E-genet i SARS-CoV-2-virus. Dette er det gen, der hjælper virussen med at bygge en sfærisk kappe omkring det. På dette tidspunkt blev TrueNat-maskiner brugt som en screeningstest. Prøver, der blev påvist med E-genet, kunne sendes til bekræftende RT-PCR-test i laboratorier. Men de nye maskiner er nu udstyret til at detektere RdRp-enzymet, der findes i virus-RNA'et, og derfor har ICMR afgjort, at disse tests kan behandles som en bekræftelse på tilstedeværelsen af ​​det nye coronavirus.

Den store forskel er, at maskinen er bærbar, og test med den koster meget mindre end de traditionelle RT-PCR tests. Det gør det ekstremt nyttigt til udrulning i indre distrikter og fjerne steder, hvorfra det er en vanskelig opgave at indsamle og sende vatpinde til test i storbyer. Faktisk er disse maskiner allerede blevet indsat i landsbyer i det nordlige kystbælte i Andhra Pradesh og inde i de skovklædte områder i Gadchiroli-distriktet.

Hvordan udføres testen?

Når podepinden er indsamlet i kiosker, der er opstillet disse steder, eller i indeslutningszoner eller sundhedslejre, dyppes den i et viralt transmissionsmedium, hvor den bliver neutraliseret. På det primære sundhedscenter eller et nærliggende laboratorium overføres det til en anden væske, en viral lysis bugger, hvor cellerne knækker og urenhederne fjernes. En del af denne væske overføres derefter til en patron, der ligner en fladtrykt tapekassette og indsættes i en maskine meget som en kassetteafspiller. Afspil-knappen aktiverer processen. På kun omkring 20 minutter ekstraherer processen RNA'et, signatursættet af genominstruktioner, som beordrer en celle til at formere virussen, når den kommer ind i en menneskelig celle. Dette RNA-ekstrakt overføres derefter til en anden maskine, hvor væsken frigives til en miniaturebrønd, der er fastgjort til en elektronisk chip, der ikke er større end en menneskelig tommelfinger.

gas abe kastet løn

Mens miniaturebrønden er det sted, hvor reagenset aktiverer RNA'et, er det chippen, der fodres med alle beregningerne af virusmængden, der hjælper med at opdage, om en person bærer virussen eller ej. I modsætning til de konventionelle RT-PCR-tests kræver reagenserne ikke ekstreme temperaturer i denne proces, og mængden af ​​podning, der kræves til testning, er også meget mindre.

I betragtning af at maskinerne blev udviklet til test for tuberkulose, krævede de så tilpasning til Covid-19 test?

Maskinen, designet af Goa-baserede Molbio Diagnostics Private Limited, blev oprindeligt udviklet til diagnosticering af tuberkulose, som rammer mindst en million børn hvert år. Et resultat af mindst ti års forskning var disse maskiner først for nylig blevet godkendt af Verdenssundhedsorganisationen (WHO), som attesterede, at disse maskiner udviste samme nøjagtighed som andre WHO godkendte kommercielle produkter til dette formål. Disse maskiner var klar til at blive indsat fra april i år.

Det var da Covid skete, sagde Shiva Sriram, national salgschef for Molbio Diagnostics, der sidder i Goa-produktionsdivisionen. TB kræver tidlig opdagelse, og derfor er det vigtigt at have præcis diagnose. I modsætning til udstrygningsmikroskopi, som har en nøjagtighed på 50:50, ønskede vi at opnå bedre nøjagtighed og holdt vores forskning i gang. Det har været 18 års forskning…, sagde han.

Maskinens hjerte er designet til at opdage forskellige former for infektioner. Det er den chip, der er specifik for hver infektion. Virksomheden tog 15 dage at designe chippen, som havde al virusbelastningsdiagnose til at påvise Coronavirus.

Ifølge Sriram havde virksomheden travlt med at lave leveringsarrangementer for modtagerlisten, som det blev leveret af Sundhedsministeriet til TB-diagnostik. Fem hundrede maskiner blev delt mellem alle stater og unionsområder. Herefter var staterne begyndt at afgive ordrer på egen hånd. I dag er omkring 1.000 maskiner allerede reserveret, og vi forventer, at der vil blive bestilt yderligere 3.000 til 4.000 i løbet af de næste to måneder, sagde han.

Det var Goa, der først købte den nye modificerede maskine til Covid-19-screening. Men Andhra Pradesh var den stat, der brugte det mest, og kørte mere end 2,5 lakh screeningstest.

Efterspørgslen voksede, da sagerne begyndte at stige i stater som Bihar, Uttar Pradesh og Odisha, da migranter begyndte at vende tilbage i den anden uge af maj. Maskinen har allerede muliggjort dør-til-dør undersøgelser i mange dele af disse stater.

Hvordan kan TrueNat sammenlignes med konventionelle tests?

Konventionel RT-PCR kræver, at RNA-ekstraktion og -analyse udføres i to forskellige rum med kølerum og uddannede eksperter, der håndterer laboratoriedesignet udstyr. TrueNat på den anden side er designet primært til at arbejde på fjerntliggende steder og betragtes som 'sidste mile-diagnostik'.

Maskinen er bærbar og kan medbringes i en mappe, er batteridrevet med én opladning, der varer ti timer. En otte-timers vagt giver 45 tests, og de fleste af staterne kører i øjeblikket tre skift om dagen, sagde Sriram. De fleste stater har også bestilt de fire spilleautomater, som gør det muligt at udføre fire tests samtidigt, sagde han.

Hver af de fire spilleautomater koster op til 13 lakh Rs, men testsættet kommer kun til omkring 1.300 Rs.

Del Med Dine Venner: