Forklaret: Fem trin til at opdage coronavirus (COVID-19)
Processen blev forklaret til The Indian Express af Dr. V Ravi, Senior Professor & Head, Department of Neurovirology, NIMHANS.
Falsk blod ses i reagensglas mærket med coronavirus (COVID-19) i denne illustration taget 17. marts 2020. (Reuters) Dr. V Ravi, seniorprofessor og leder, afdeling for neurovirologi, NIMHANS, forklarer processen med at opdage coronavirus til denne hjemmeside . Her er de fem trin:
chase chrisley nettoværdi
Indsamling og transport
Testcenter tager podninger fra næsehulerne og bagsiden af svælget (svælg) og anbringer prøver i et virustransportmedium, som indeholder balancerede salte og albumin for at forhindre, at virussen går i opløsning. Prøven transporteres derefter på køl til testlaboratoriet.
Ekstraktion af viralt RNA
Coronaviruss såsom SARS-CoV (som opstod i Kina i 2002-03), MERS-CoV (som dukkede op i Saudi-Arabien i 2012) eller den nuværende SARS-CoV-2, som har forårsaget COVID-19-pandemien, har store enkeltstrengede RNA-genomer. Testlaboratoriet ekstraherer RNA'et fra prøverne ved hjælp af kommercielt tilgængelige kits (såsom dem fremstillet af virksomheder som QIAGEN.)
Sætter RNA'et i PCR-blandingen
Ekstraheret RNA sættes til en blanding af polymerasekædereaktion (PCR). Dette inkluderer 'master mix', som indeholder et 'revers transcriptase'-enzym, der omdanner RNA'et til DNA. Mastermix indeholder Taq-polymerase, enzymet, der skaber kopier af DNA'et, nukleotider samt andre elementer såsom magnesium - en ion af hvilken er nødvendig for at amplificere DNA'et.
PCR-blandingen indeholder også 'reagenser' såsom 'primere' og 'prober'. Primere er særlige DNA-strenge, der er designet til at binde med det DNA, der skal kopieres; prober bruges til at påvise den specifikke sekvens i DNA-prøven. WHO har anbefalet specifikke primere og prober til test for COVID-19.
Endelig består PCR-blandingen af et husholdningsgen - et normalt humant gen (RNase P), der bruges til at sikre, at prøver blev korrekt indsamlet og RNA ekstraheret.
AmpLifikation af det virale DNA
Prøven i sin PCR-blanding sættes i rør eller plader, som derefter sættes i en termisk cyklusmaskine, der bruges til at udføre PCR-processen.
Først omdannes RNA'et til DNA. Så starter processen med at kopiere generne. Den termiske cycler opvarmer og afkøler blandingen med prøven, alternerende mellem tre temperaturer - til at smelte DNA'et for at adskille de to strenge, for at primeren binder til DNA'et og til at syntetisere en ny streng - alt sammen inden for en cyklus, der varer en minut. Den termiske cycler kører 30-40 sådanne cyklusser for at amplificere DNA'et for at tjekke for virus.
Test mod kontroller
Amplificeret DNA testes mod en positiv kontrol, som normalt består af gener fra virussen klonet ind i plasmid, og en negativ kontrol, som er en 'kendt' prøve, der tidligere har testet negativ for virussen.
RNase P bør vise amplifikation, positiv kontrol bør være positiv, negativ kontrol bør være negativ, og så er det resultat, du får for prøven, det korrekte resultat, sagde neurovirolog Dr. V Ravi. For at en test skal være gyldig, før resultatet frigives, skal visse 'gyldighedskriterier' være opfyldt.
Gå ikke glip af Explained | Sådan fungerer COVID-19-testen
Hvis husholdningsgenet (RNase P) er positivt, positiv kontrol er positiv, negativ kontrol er negativ, og prøven ikke viser noget PCR-positivt resultat, er prøven erklæret negativ for SARS-CoV-2-virus-RNA. Hvis PCR-resultatet er positivt, har patienten COVID-19.
Del Med Dine Venner:
