Forklaret: Hvordan coronavirus (COVID-19) testen virker

Hvordan ser PCR-testen ud for virus i podningsprøver? Hvor lang tid tager det? Hvor mange prøver tester Indien dagligt, og kan det teste flere? Hvis det kan, hvorfor er det så ikke opskaleret endnu?

Indien udfører i øjeblikket en to-trins realtids-PCR for at teste for SARS-COV-2. (Reuters)

Hvad er den diagnostiske test for den nye coronavirus, der forårsager COVID-19?

Det Indian Council of Medical Research (ICMR) har sagt udpegede laboratorier vil bruge den konventionelle real-time polymerase kædereaktion (PCR) test, som udføres på vatpind opsamlet fra bagsiden af ​​halsen, en væskeprøve fra de nedre luftveje eller en simpel spytprøve. Sådanne tests er almindeligt anvendt til påvisning af influenza A, influenza B og H1N1 virus.

Hvad er PCR-testen?

Den bruger en teknik, der skaber kopier af et DNA-segment. 'Polymerase' refererer til de enzymer, der laver kopierne af DNA. 'Kædereaktionen' er, hvordan DNA-fragmenterne kopieres eksponentielt - en kopieres til to, de to kopieres til fire, og så videre. Kary Mullis, den amerikanske biokemiker, der opfandt PCR-teknikken, blev tildelt Nobelprisen i kemi i 1993.

Men SARS-COV-2 er en virus lavet af RNA, som skal omdannes til DNA. Til dette inkluderer teknikken en proces kaldet omvendt transkription. Et 'omvendt transkriptase'-enzym omdanner RNA'et til DNA. Kopier af DNA'et laves derefter og amplificeres. Et fluorescerende DNA-bindende farvestof kaldet proben viser tilstedeværelsen af ​​virussen. Testen adskiller også SARS-COV-2 fra andre vira.

Hvor lang tid tager PCR-processen?

Real-time PCR'er har nedbragt den tid, det tager at teste prøver til 4,5 timer fra omkring 6 timer tidligere, sagde ICMR-forsker Dr. R R Gangakhedkar. Men den overordnede ekspeditionstid - fra det tidspunkt, hvor prøverne indsamles, til rapporten leveres - er omkring 24 timer og burde være mindre, sagde han.

Forklaret: Fem trin til at opdage coronavirus

Hvordan foregår testen i Indien?

Indien udfører i øjeblikket en to-trins realtids-PCR for at teste for SARS-COV-2, sagde NIMHANS Senior Professor og Head of Neurovirology, Dr V Ravi. Den første fase er designet til at detektere genetiske elementer, der er fælles for humane coronavirus, og som kan eksistere i prøven. Den anden fase er designet til at teste for specifikke gener, der kun er til stede i SARS-COV-2 virus.

Indtil begyndelsen af ​​marts, den indledende screening test for at tjekke for enhver type coronavirus blev udført af alle laboratorier, men den bekræftende PCR blev kun udført af National Institute of Virology i Pune. Derefter overførte NIV Pune teknologien (reagenser, der kræves til bekræftelsen) til alle laboratorier, så der ikke var behov for en prøve til at gå hele vejen til Pune. Dette har skåret ned på den tid, det tager at teste prøverne, sagde Dr. Ravi.

Coronavirus-test: Falsk blod ses i reagensglas mærket med coronavirus (COVID-19) i denne illustration taget 17. marts 2020. (Reuters Illustration: Dado RuvicO

Tester Indien nok tal?

Indien har kapacitet til at teste 10.000 prøver dagligt og tester i øjeblikket omkring 600-700. Til sammenligning tester Sydkorea, som har en lignende ekspeditionstid, efter sigende op til 20.000 prøver om dagen, især ved at bruge modeller som dets drive-through-testfaciliteter.

Regeringen hævder, at det ikke er nødvendigt på nuværende tidspunkt at teste hver person. Landet tester den kohorte, som det skal teste for nu, sagde Dr. Gangakhedkar. Hvis du går efter lokaliseret transmission, tester vi nok. Hvis du mener, at der er fællesskabsbaseret transmission, så er det et andet problem. Der er stadig ingen beviser, hvor vi ikke ved, hvordan indekssagen har fået denne infektion, sagde han.

emma bunton alder

Express Explained er nu på Telegram. Klik her for at deltage i vores kanal (@ieexplained) og hold dig opdateret med det seneste

Vi ønsker ikke at lave nogen vilkårlig test, for nu beder alle om en test. Så et eller andet sted bliver vi nødt til at rationalisere det ... men det er også vigtigt at holde øje, så vi ikke går glip af samfundstransmission, sagde ICMR-forsker Dr Nivedita Gupta under en pressebriefing i sidste uge.

marvel vs dc film salg

Hvad vil strategien være, hvis samfundsoverførsel sker?

ICMR udfører en overvågning for ethvert bevis på samfundsoverførsel, hvor hvert af Indiens 52 testlaboratorier tester 20 tilfældige prøver af patienter med alvorlig akut luftvejsinfektion (SARI). Det 'første snit' af disse test forventes at være ude på onsdag. ICMR har sagt, at i tilfælde af at et tilfælde af samfundsoverførsel bliver afdækket fra disse overvågningstests, vil regeringens strategier være helt anderledes.

Coronavirus-pandemi: På et hospital i New Delhi. (PTI foto/fil)

Er der barrierer for at opskalere test?

Omkostninger er en potentiel barriere, føler nogle eksperter. ICMR-embedsmænd havde på en konference sagt, at prisen på en primær test for COVID-19 er 1.500 Rs. Hvis der skal udføres en anden test for at bekræfte resultaterne af den første test, er de samlede omkostninger omkring 5.000 Rs. En af embedsmændene havde også sagt, at de anvendte sonder, som er importeret fra Tyskland, er en begrænsende faktor.

Mens antallet af testcentre er blevet øget, er importen af ​​sonder også steget. I sidste uge ønskede Indien at importere omkring 200.000 sonder, mens Dr. Gangakhedkar mandag sagde, at regeringen planlagde at importere omkring en million.

Coronavirus pandemi: Hvornår skal man teste og hvem

Kunne Indien gøre tingene anderledes?

Det, Indien var begyndt at gøre, er præcis, hvad der blev anbefalet til et land, hvor sygdommen blev importeret, ifølge Translational Health Science and Technology Institute Indiens administrerende direktør, Dr. Gagandeep Kang. Test og opfølgning af dem, der kommer ind i landet, og at sætte dem, de er kommet i kontakt med under overvågning, er en rationel og passende tilgang, hvis den eneste risiko var at importere sygdommen, og opfølgning og test var 100 %, hun sagde.

Men hvad der kan ske, er, at du med denne infektion kan falde ud, selv før du udvikler symptomer, og i meget få tilfælde har du måske aldrig symptomer, så du kan overføre det til andre mennesker uden at vide, at du er inficeret, sagde hun. Denne form for kompleksitet ... gør det nødvendigt at tænke på at have en backup-strategi for at se, om du rent faktisk er gået glip af noget, sagde hun. Der er mere, vi kunne gøre.

Vil ICMR-overvågningen hjælpe?

ICMRs beslutning er et godt skridt, men der er regioner, som en sådan øvelse så ville udelade, sagde Dr. Kang. Hvis du tester prøver hver uge fra hvert influenzalaboratorium, så hvis du finder blot én positiv, vil det fortælle dig, at du er gået glip af meget, sagde hun.

Ifølge Dr. Kang er det muligt at bruge matematisk modellering til at forstå, hvad der ville give regeringen en rimelig chance for at identificere, om der allerede er nogen samfundsoverførsel. Jeg synes, det ville være fantastisk at have den slags model, som Singapore har, hvor enhver læge, hvor som helst, der havde en klinisk mistanke, selv om det ikke passede til beskrivelsen, fik lov til at sende deres patient til en test, tilføjede hun.

– Input af Kaunain Sheriff M

Del Med Dine Venner: