Forklaret: B.1.617-variant og Covid-19-stigningen i Indien

Genom-sekventeringsdata har præsenteret beviser for den 'dobbelte mutant' i 61% af prøverne i Maharashtra. Men om denne nye variant driver Indiens igangværende stigning, kan kun siges, når flere data er tilgængelige.

Sundhedspersonale forbereder senge i Shehnai Bankethal i New Delhi, som er blevet omdannet til en midlertidig afdeling for Covid-9-patienter. (Express Foto: Amit Mehra)

Under et møde med distriktslaboratorier i Maharashtra i sidste uge delte National Institute of Virology (NIV) begrænsede data, der viser en opdeling af 361 genomsekventerede prøver indsamlet mellem januar og marts i år.

Overskriftsfundet fra analysen : Tilstedeværelsen af ​​en dobbeltmutation blev påvist i 220 — næsten 61 procent — af prøverne. Denne dobbelte variant blev i sidste uge klassificeret som B.1.617 varianten.

Nyhedsbrev| Klik for at få dagens bedste forklaringer i din indbakke

Hvad er B.1.617?

B.1.617-varianten af ​​SARS-CoV-2 bærer to mutationer, E484Q og L452R. Begge findes separat i mange andre coronavirus-varianter, men de er blevet rapporteret sammen for første gang i Indien.

De to mutationer findes i virussens spidsprotein. Spikeproteinet hjælper virussen med at binde sig til den menneskelige celles receptorer og få adgang til en værtscelle.

E484Q-mutationen ligner E484K, en mutation fundet i varianter af coronavirus i Storbritannien (afstamning B.1.1.7) og Sydafrika (B.1.351).

L452R-mutationen er blevet fundet i hurtigspredningsvarianter i Californien (B.1.427 og B.1.429). Det kan øge bindingskraften af ​​spidsproteiner med ACE2-receptorer på humane celler, hvilket gør det mere overførbart. L452R kan også potentielt forbedre viral replikation.

Tilsammen er E484Q og L452R mere infektiøse og kan undgå antistoffer.

Hvor er B.1.617 blevet fundet?

Der er begrænset data. Det blev først rapporteret fra Maharashtra. I januar blev 19 prøver fra forskellige distrikter sekventeret, og B.1.617 blev fundet i fire. I februar blev 234 prøver sekventeret fra 18 distrikter, og 151 prøver - fra mindst 16 distrikter - havde denne variant. Og i marts havde hele 65 af 94 prøver det.

Indtil videre har Amravati, Nagpur, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabad og Chandrapur distrikterne fremlagt stærke beviser på tilstedeværelsen af ​​B.1.617. Færre prøver blev sekventeret i andre distrikter, og varianten blev fundet i nogle. Sekvensering afventer for flere prøver.

DELTAG NU :Express Explained Telegram Channel

Er denne variant mere virulent?

Der er ingen beviser indtil videre. De fleste patienter kan klare sig med hjemmeisolering, selvom klinisk erfaring skal kombineres med genomsekventeringsdata for at generere videnskabelig dokumentation. Kliniske anekdoter fra læger tyder på, at varianten spredes hurtigere, er mere smitsom, kan inficere hele familier, men er mindre virulent og forårsager ikke dramatisk flere indlæggelser.

De fleste patienter er asymptomatiske, og det er en god indikation. Men i absolutte tal har så mange tilfælde lagt en byrde på sundhedsinfrastrukturen, sagde Dr. Shashank Joshi, ekspert i Maharashtra Covid Task Force.

Hvor meget har det spredt sig?

Dr. Sujeet Singh, direktør for National Center for Disease Control (NCDC) har påpeget, at meget få prøver fra Maharashtra er blevet sekventeret indtil videre, og det er for tidligt at drage endelige konklusioner om, hvor udbredt dobbeltmutanten er. Imidlertid havde centralregeringen rapporteret i marts, at 15-20 procent prøver i Maharashtra havde denne variant; på baggrund af de seneste sekventeringsdata ved vi, at dette tal nu er over 60 pct.

Klinikere og distriktsadministratorer i Maharashtra rapporterer, at i modsætning til den første bølge bliver hele familier smittet i den anden bølge. Dette kan indikere enten, at fysisk afstands- og isolationsforanstaltninger er utilstrækkelige i husstanden, eller at virussen er blevet mere overførbar.

josh peck nettoværdi 2015

Kan B.1.617 være drivkraften bag den igangværende stigning i Covid-19 tilfælde?

Dr. Gangandeep Kang, professor i mikrobiologi ved Christian Medical College, Vellore, sagde, at 60,9 procent prøver med denne variant højst sandsynligt viste en sammenhæng mellem mutationen og stigningen - dog for et præcist svar mindst 1 procent af Covid-19 prøverne skal sekvenseres hver uge. Med Indien i øjeblikket tester over 1 lakh tilfælde dagligt, og dette ville oversætte til omkring 1.000 genomsekvenser hver dag.

Vi skal også se på, hvor mange mennesker en person er i stand til at inficere, og RT-PCR-cyklustærsklen. Vi skal lave live tracking. Data fra januar har ringe værdi i april, sagde Dr. Kang.

Dr. Gautam Menon, professor ved Ashoka University, Sonepat, og ved Institute of Mathematical Sciences, Chennai, sagde: Det, vi har, er suggestivt, men vi har brug for flere genom-sekventeringsdata for at forstå, hvilken variant der driver antallet af nye infektioner i forskellige stater... For at antyde, at stigningen i tilfælde skyldes denne dobbeltmutante variant, burde vi have flere tidspunkter. For eksempel, hvis vi kunne sige, at vi opdagede 30 procent af denne variant i prøver den 30. marts og derefter 40 procent i prøver den 14. april, ville det tyde på, at den nye variant dominerer spredningen af ​​sygdommen.

Dr. Menon understregede også behovet for større datagennemsigtighed. Det er muligt, selvom det bliver mere og mere usandsynligt, at sagerne også kan forbindes med den tidligere stamme, sagde han. Medmindre vi ved, i hvilket omfang stigningen kan henføres til den nye variant, vil vi ikke være i stand til endeligt at afgøre, om lempelser i Covid-passende adfærd med den ældre stamme har drevet stigningerne, eller om den øgede smitteevne af den nye variant er ansvarlig.

Prof Vinod Scaria, ledende videnskabsmand, CSIR -IGIB, var enig i, at vi ikke endegyldigt kan sige, at disse varianter driver stigningen i den anden bølge. Beviser tyder dog på, at i det mindste i nogle stater er B.1.1617-slægten fremherskende og kan bidrage til stigningen i sager, sagde han. Denne afstamning er defineret af 15 genetiske varianter, herunder seks spike proteinvarianter. To af disse (E484Q og L452R) er involveret i immunflugt såvel som øget smitteevne, sagde professor Scaria.

Kan varianten undgå vacciner?

Igen er dataene begrænsede. Nogle mennesker er faktisk blevet inficeret efter den første dosis, men der er ingen data om, hvorvidt deres prøver blev sendt til genomsekventering.

Vi ved, at den sydafrikanske variant er mere i stand til at undslippe immunrespons. Vi ved, at den britiske variant er den mest overførbare. Men vi ved intet om B.1.617 indtil videre, fordi vi ikke sammensætter data for at drage konklusioner, sagde Dr. Kang.

Dr. Menon understregede, at selvom vacciner ikke forventes at forhindre infektion, forhindrer de bestemt alvorlig sygdom og død. Vi forventer, at dette vil forblive sandt selv med den nye variant. Den eneste mellem- til langsigtede løsning til at håndtere Covid-19 er, at folk bliver vaccineret.

Del Med Dine Venner: